Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hps1O08983 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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