Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm2056J3QQ02 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms