Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Taf4bG5E8Z2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Taf4bG5E8Z2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms