Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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