Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm28048F7BCN0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm28048F7BCN0 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm28048F7BCN0 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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