Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Samd1D3YXK1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Samd1D3YXK1 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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