Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gbp4A4UUI3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gbp4A4UUI3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms