Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Ndrg3Q9QYF9 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Ndrg3Q9QYF9 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ndrg3Q9QYF9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms