Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
ClpxQ9JHS4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms