Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
OtofQ9ESF1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
OtofQ9ESF1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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