Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Rnft1Q9DCN7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnft1Q9DCN7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rnft1Q9DCN7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Rnft1Q9DCN7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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