Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hdac9Q99N13 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdac9Q99N13 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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