Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Xrcc4Q924T3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Xrcc4Q924T3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Xrcc4Q924T3 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms