Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Stx18Q8VDS8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms