Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Sh2d1a-201ENSMUST00000005839 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim35Q8C006 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm11279-201ENSMUST00000121524 1256 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim35Q8C006 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim35Q8C006 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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