Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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