Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ChfrQ810L3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms