Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trak1Q6PD31 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trak1Q6PD31 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms