Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Atg16l2Q6KAU8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Atg16l2Q6KAU8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Atg16l2Q6KAU8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Atg16l2Q6KAU8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Atg16l2Q6KAU8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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