Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tpm4Q6IRU2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tpm4Q6IRU2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tpm4Q6IRU2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tpm4Q6IRU2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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