Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tbr1Q64336 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Tbr1Q64336 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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