Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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PtprnQ60673 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprnQ60673 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms