Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm18118-201ENSMUST00000201064 645 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tcstv3-202ENSMUST00000223967 779 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cdc42se1-202ENSMUST00000107199 652 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trex1-202ENSMUST00000112053 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm13623-201ENSMUST00000118359 625 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm44659-201ENSMUST00000207269 436 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tnni2-201ENSMUST00000105971 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Chn2-203ENSMUST00000114401 1269 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Scp2-ps2-201ENSMUST00000072166 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Entpd8-202ENSMUST00000114376 1942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm17806-201ENSMUST00000195844 383 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm32858-201ENSMUST00000205246 585 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm39481-201ENSMUST00000210379 512 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms