Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms