Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NfiaQ02780 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms