Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ctnnb1Q02248 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms