Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Arf1P84078 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Arf1P84078 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms