Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rab1AP62821 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rab1AP62821 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Rab1AP62821 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rab1AP62821 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rab1AP62821 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
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