Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CckbrP56481 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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