Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Irf5P56477 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Irf5P56477 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Irf5P56477 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Irf5P56477 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Irf5P56477 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Irf5P56477 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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