Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa8P50706 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Defa8P50706 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms