Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TgfaP48030 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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