Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Timp3P39876 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Timp3P39876 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms