Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxrbP28704 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrbP28704 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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