Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Hoxd10P28359 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Hoxd10P28359 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms