Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Casq1O09165 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Casq1O09165 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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