Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Efna3O08545 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Efna3O08545 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms