Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Bbip1J3QMK2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms