Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28048F7BCN0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28048F7BCN0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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