Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cfap46E9Q2C0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms