Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Vpreb3D3Z6J4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Arid5b-204ENSMUST00000219238 7581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb3D3Z6J4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms