Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Kif28pD3YXS5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms