Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmf1B9EKI3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms