Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ssxb8B1AY40 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb8B1AY40 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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