Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Skint4A7TZF3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms