Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Cldn34c4A2ANA3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms