Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28036V9GXJ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28036V9GXJ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28036V9GXJ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28036V9GXJ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms