Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Top3bQ9Z321 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Top3bQ9Z321 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms