Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt27Q9Z320 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt27Q9Z320 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt27Q9Z320 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt27Q9Z320 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt27Q9Z320 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt27Q9Z320 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt27Q9Z320 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt27Q9Z320 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Krt27Q9Z320 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt27Q9Z320 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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