Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CcniQ9Z2V9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CcniQ9Z2V9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms